Σε μεγάλο τηγάνι ζεσταίνουμε το μισό ελαιόλαδο και σοτάρουμε το κρεμμύδι μέχρι να γίνει διάφανο.
Προσθέτουμε τα μανιτάρια και τα σοτάρουμε σε δυνατή φωτιά μέχρι να εξατμιστούν πλήρως τα υγρά τους. Θέλουμε στεγνό αλλά μεστό αποτέλεσμα.
Αλατοπιπερώνουμε, προσθέτουμε το θυμάρι, ανακατεύουμε και αφήνουμε τη γέμιση να γίνει χλιαρή.
Σε μπολ χτυπάμε τα αβγά με το γιαούρτι μέχρι να ομογενοποιηθούν.
Προσθέτουμε τη γραβιέρα και τη φέτα και ανακατεύουμε. Ρίχνουμε μέσα και τα μανιτάρια.
Λαδώνουμε το ταψί και στρώνουμε το φύλλο,
Απλώνουμε τη γέμιση ομοιόμορφα.
Καλύπτουμε με τα φύλλα, γυρίζοντας τις άκρες προς τα μέσα.
Χαράζουμε ελαφρά, πασπαλίζουμε με μαύρο σουσάμι και ραντίζουμε με το υπόλοιπο ελαιόλαδο.
Ψήνουμε σε προθερμασμένο φούρνο στους 180°C, για 50 λεπτά, μέχρι να ροδίσει βαθιά και να γίνει τραγανή.